Владимир Хотиненко родился 20 января 1952 года в городе Славгород, Алтайский край.
В 1976 году с отличием окончил Уральский государственный архитектурно-художественный университет. После службы в армии поступил на Высшие курсы сценаристов и режиссеров, в мастерскую Никиты Михалкова. До 1982 года работал художником — постановщиком на Свердловской киностудии.
Далее являлся ассистентом режиссера у Никиты Михалкова на фильмах «Несколько дней из жизни Обломова», «Пять вечеров», «Родня». Режиссерским дебютом Хотиненко стал фильм «Один и без оружия», который он снял в паре с Павлом Фаттахутдиновым в 1984 году.
Снятый в 1995 году фильм «Мусульманин» получил Гран-при жюри Международного кинофестиваля в Монреале и многие другие награды.
В это же время на экранах появился снятый Хотиненко исторический сериал «Гибель империи». Вскоре вышла драма о гибели подводной лодки «72 метра», поставленная по мотивам повести писателя Александра Покровского.
Выход практически каждого его фильма становился событием в кинематографе, среди них «Зеркало для героя», «СВ. Спальный вагон», «Рой», «Патриотическая комедия», «Страстной бульвар», «1612» и другие.
В 2005 году Хотиненко выпустил художественно-публицистический фильм «Паломничество в Вечный город», посвященный истории христианства в Риме в первые четыре века нашей эры. Фильм «Поп» в 2009 году удостоен первой Патриаршей премии в области киноискусства.
Далее выходят его сериалы «Достоевский» и «Бесы», драма «Наследники».
Последние работы основаны на историческом материале: сериалы «Демон революции», «Меморандум Парвуса», фильм «Ленин. Неизбежность».
Он является продюсером ряда собственных фильмов и сериалов.
Владимир Хотиненко давно и успешно занимается педагогической деятельностью, преподает на Высших курсах режиссеров и сценаристов, во ВГИКе им. С.А.Герасимова. Руководит мастерской факультета режиссуры в Московском институте телевидения и радиовещания «Останкино», ведет свою мастерскую в Академии кинематографического и театрального искусства Никиты Михалкова.
Владимир Хотиненко входит в состав Совета при президенте по культуре и искусству, в состав Патриаршего совета по культуре. С 26 июля 2010 года является членом Патриаршего Совета по культуре Русской православной церкви.
По предложению Главы государства Владимира Путина 20 марта 2017 года, Владимир Иванович Хотиненко утвержден в составе Общественной палаты Российской Федерации.
Является лауреатом премий: ТЭФИ, НИКА, Золотой Орел, а также многочисленных наград российских и международных кинофестивалей. Лауреат Всесоюзного кинофестиваля в номинации Специальный приз за 1988 год («Зеркало для героя»). Премия «Киношок» в номинации «Премия за режиссуру» за 1992 год («Патриотическая комедия»). Премия «Киношок» в номинации «Главная премия» за 1993 год («Макаров»). Премия «НИКА» в номинации «Лучший игровой фильм и Лучшая режиссерская работа» за 1993 год («Макаров»). Финалист программы «Номинация. Кино. XXI век» на кинофоруме в Ялте в 1994 году с фильмом «Макаров». Гран-при Международного кинофестиваля в Монреале, 1995 («Мусульманин»). Премия ТЭФИ (2006) в номинации «Сценарист телевизионного документального фильма/сериала» («Паломничество в Вечный город», «Апостол Павел»). Особое упоминание ФИПРЕССИ на XXI Московском кинофестивале («Страстной бульвар»). Премия ФСБ России (номинация «Кино- и телефильмы», 2006) — за телевизионный художественный фильм «Гибель империи». Заслуженный деятель искусств Российской Федерации (15 января 2001) — за заслуги в области искусства. Народный артист Российской Федерации (3 марта 2010) — за большие заслуги в области искусства. Медаль священномученика Иоанна, архиепископа Рижского I степени (Латвийская православная церковь, 2010). Лауреат премии «Человек года-2013» (27 ноября 2013).
Союз кинематографистов России поздравляет Владимира Хотиненко с юбилеем, желает много новых интересных творческих планов и свершений!
